膿毒癥患者中性粒細胞差異表達基因及信號通路的生物信息學分析
關鍵詞：膿毒癥 中性粒細胞 差異表達基因 關鍵基因 蛋白相互作用網絡
摘要：目的尋找膿毒癥患者中性粒細胞中發生差異變化的致病相關基因及關鍵通路。方法從基因表達匯編(GEO)數據庫下載GSE6535、GSE49755、GSE49756、GSE49757,其中包含143個實驗組樣本及65個對照組樣本的基因芯片數據。采用R軟件的相關程序包篩選鑒定出中性粒細胞差異表達基因(DEG)。通過兩兩交集,得到共93個DEG,進一步用DAVID、STRING及Cytoscape里的ReactomeFIPlugIn和Cytohubba應用程序等多種方法進行基因功能和通路富集分析、PPI網絡分析和關鍵基因分析。結果確定中性粒細胞最重要的關鍵DEG,包括Toll樣受體2(TLR2)、原癌基因SRC、基質金屬蛋白酶9(MMP9)、白細胞介素1受體2(IL1R2)、抑制蛋白β1(ARRB1)、白細胞介素1受體相關激酶3(IRAK3)、白細胞介素18受體1(IL18R1)、白細胞介素18受體相關蛋白(IL18RAP)、絲氨酸/蘇氨酸激酶17b(STK17B);發現了一些涉及膿毒癥患者致病相關的通路以及免疫相關的生物學過程。結論這些基因可能通過多種信號通路引起膿毒癥的發生發展。
細胞與分子免疫學雜志要求:
{1}請在文稿后面注明稿件聯系人的姓名、工作單位、地址、電話、郵箱等信息，以便本刊編輯聯系有關事宜。
{2}本刊各欄目歡迎讀者投稿，來稿不退，敬請作者自留底稿，一個月內如未收到采用通知，稿件請自行處理。
{3}文中一級標題、二級標題、三級標題、四級標題的序號用“一、……”“（一）……”“1．……”“（1）……”標示。
{4}同一文獻兩次或兩次以上引用，第二次引用時，若緊接第一次引用注文，則徑注“同上注，第×頁”；若第二次與第一次引用之間有其他注釋，則在作者名之后，注明“前引注N，第×頁”。
{5}摘要應以第三人稱撰寫，以介紹論文內容概要為目的.不應有評價性詞語，摘要內容包括研究目的、方法、結果和結論等。
注：因版權方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
