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西太平洋浮游有孔蟲Globigerinita glutinata種內SSU rDNA多樣性研究

石峻峰; 類彥立; 李鐵剛; 翦知湣; 李青霞 )中國科學院海洋研究所海洋生物分類與系統演化實驗室; 青島266071; )自然資源部第一海洋研究所海洋沉積與環境地質國家海洋局重點實驗室; 青島266061; )同濟大學海洋與地球科學學院; 上海200092; )中國科學院大學; 北京100049; )中國科學院海洋大科學研究中心; 青島266071

關鍵詞:globigerinita glutinata 活體浮游有孔蟲 單細胞pcr 克隆技術 

摘要:有孔蟲分子鑒定和分子多樣性研究多基于SSU rDNA序列片段分析,但某些浮游種內可能存在基因組內rDNA變化,影響分類學和分子生態學的研究結果。為了研究浮游有孔蟲物種內是否存在rDNA多樣性,本工作以采自熱帶西太平洋的浮游有孔蟲Globigerinita glutinata活體標本作為研究對象,經形態學鑒定后,利用單細胞PCR和克隆技術,獲得5個蟲體的20條SSU rDNA目的片段(300—400 bp),同時對其序列結構進行了研究。結果顯示,同種G.glutinata出現了四類不同的SSU rDNA核酸類型。序列成對分析顯示,該種遺傳距離差異最長可達0.249,遠高于其它物種。此外,同一樣本不同克隆片段中,出現了高達四個不同的SSU rDNA核酸型。序列的差異主要集中在三個不同的高變異區,高可變區的長度范圍為21 bp到63 bp。從差異序列的間隔分布推斷,核糖體基因簇的重組可能是不同SSU rDNA核酸型出現的原因。本工作在國內首次揭示了熱帶西太平洋浮游有孔蟲G.glutinata種內的SSU rD NA核酸型,研究結果表明G.glutinata的種內SSU rDNA變異性極大,復雜的生活史以及假基因的存在或許是造成該現象的原因。

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