基于SNP分型的香菇交配型AS-PCR鑒定
張美彥; 宋春艷; 于海龍; 譚琦; 徐珍; 王瑞娟; 章爐軍; 尚曉冬 上海市農業科學院食用菌研究所; 農業部南方食用菌資源利用重點實驗室; 國家食用菌工程技術研究中心; 上海市農業遺傳育種重點實驗室; 上海201403
關鍵詞：香菇 交配型 單核體 snp
摘要：目前食用菌的交配型鑒定通常采用單核體兩兩交配后鏡檢觀察鎖狀聯合的方式進行,工作量大,耗時長且易產生人為誤檢。本研究以香菇(Lentinula edodes)菌株"申香215"為例,通過對需鑒定交配型的單核體的雙核體親本菌株進行基因組重測序,獲得雙核體交配型A和B因子區域的序列比對信息,對交配型因子等位基因內部的SNP位點進行統計分析,選擇合適位點設計引物,采用等位基因特異PCR(Allele-specificPCR,AS-PCR)技術,根據擴增結果可快速確定單核體的交配型并排除雙核體和雜合體。用該方法鑒定香菇單核體的交配型,提高了鑒定效率和準確率,該方法可作為分子標記輔助育種的一種手段,為食用菌遺傳育種工作提供新的技術支撐。
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