結腸癌中核內miRNA的激活調控作用研究
關鍵詞：結腸癌 核內mirna
摘要：為了探究增強子介導的核內miRNA在結腸癌發生中的作用,本研究篩選了結腸癌中的差異表達的miRNA數據、結腸的特異性增強子數據、結腸癌中差異表達基因數據,利用細胞核內miRNA靶向增強子預測算法,篩選miRNA調控的結腸特異性增強子;利用增強子靶基因預測數據,篩選核內miRNA調控的差異表達靶基因,并且構建核內miRNA-靶基因網絡,并通過網絡的分析和篩選獲得結腸癌中關鍵的致病基因,同時對網絡中的靶基因進行GO的功能注釋。結果表明,我們所構建的核內miRNA-激活調控靶基因網絡包含miRNA-靶基因關系對2121個,259個節點,其中包含34個下調基因、183個上調的基因,7個下調的miRNA,35個上調的miRNA。而后我們分析了網絡進行的節點度的整體分布情況,發現網絡中大部分的節點的度都是小于10的,僅有少量miRNA結合和部分的差異表達基因節點的度大于10。核內miRNA主要通過激活調控了一些應激反應相關的功能和,同時,抑制調控了細胞周期、細胞凋亡、細胞死亡巨噬細胞代謝等相關功能,通過激活和抑制相關功能誘發結腸癌的發生。從核內miRNA的激活調控角度研究結腸癌的發病機制,是對原有細胞漿中miRNA抑制調控機制的補充,也為結腸癌的系統研究提供了新的視野。
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