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乙型肝炎病毒S蛋白的序列特征分析
關(guān)鍵詞：hbv病毒 s蛋白 抗原表位 生物信息學(xué)
摘要：乙肝病毒S蛋白是病毒的包膜蛋白,與病毒進(jìn)入細(xì)胞有關(guān),它存在逆轉(zhuǎn)錄過程并且具有極強(qiáng)的潛伏性。本論文應(yīng)用生物信息學(xué)分析乙肝病毒S蛋白的序列特征,利用在線分析軟件預(yù)測乙肝病毒S蛋白的理化性質(zhì)和親疏水性、跨膜區(qū)域、信號肽特征、磷酸化位點(diǎn)、二級結(jié)構(gòu)以及乙肝病毒S蛋白的最佳抗原表位形成位置等。結(jié)果顯示了乙肝病毒S蛋白由226個(gè)氨基酸組成,理論等電點(diǎn)是8.21,為不穩(wěn)定蛋白,總平均親水性為0.649,是疏水蛋白質(zhì),并且該蛋白存在信號肽,有4個(gè)跨膜區(qū),有30個(gè)潛在的磷酸化位點(diǎn),主要二級結(jié)構(gòu)為α螺旋和無規(guī)則卷曲,同時(shí),結(jié)合乙型肝炎病毒S蛋白的序列可及性、線性表位、β轉(zhuǎn)角、柔性、抗原性的預(yù)測結(jié)果,可以找到潛在的抗原表位區(qū)域,為乙型肝炎的表位疫苗研制提供重要的參考依據(jù),有利于進(jìn)一步對乙型肝炎S蛋白的抗原性進(jìn)行研究。
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