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基于線粒體Cyt b基因的龍頭魚群體遺傳結構分析
關鍵詞：龍頭魚 cyt b基因 遺傳多樣性 遺傳分化
摘要：在我國黃海、東海和南海海岸帶上,選取青島、南通、舟山、三門、寧德、泉州和湛江共7個群體164尾龍頭魚(Harpadon nehereus)為研究對象,通過PCR擴增共獲得長度為1112 bp的線粒體DNA細胞色素b(Cyt b)基因序列,共檢測到32個變異位點,其中單變異位點27個,簡約信息位點1個。164條序列定義了29個單倍型,平均單倍型多樣性(Hd)和核苷酸多樣性(π)分別為0.3026±0.0479和0.000371±0.000379,其中泉州群體的單倍型多樣性和核苷酸多樣性均最低。分析比較了不同龍頭魚群體間遺傳變異情況,發現群體間平均遺傳距離為0.00035,遺傳分化指數FST值均小于0.05,群體間沒有發生明顯的遺傳分化。AMOVA分析結果顯示龍頭魚群體遺傳差異主要來源于群體內個體間的變異。中性檢驗的Tajima’s D和Fu’s Fs統計值均為負值且顯著偏離中性,核苷酸不配對分布圖呈現明顯的單峰分布,表明龍頭魚歷史上經歷了群體擴張事件,參考已知海洋魚類Cyt b基因2%每百萬年的進化速率,估算群體擴張發生的時間大約在0.08—0.32百萬年前的第四紀更新世中晚期。
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