擬穴青蟹Cactus基因的cDNA克隆、序列及生物學功能
關鍵詞：擬穴青蟹 cactus 基因克隆 組織分布 表達分析
摘要：為獲取擬穴青蟹Cactus基因cDNA全長、分析基本生物學信息,并初步探索其在病原物刺激下的免疫反應,實驗采用RACE技術獲得了擬穴青蟹Cactus(SpCactus)基因的cDNA全長序列,其cDNA全長為2035 bp,開放閱讀框(ORF)1311 bp,編碼436個氨基酸,分子量為46.01 ku。對蛋白理化性質進行預測發(fā)現(xiàn),SpCactus為親水性蛋白,等電點pI為4.91。經(jīng)預測,SpCactus與其他物種的IκB蛋白具有相似的功能結構域。同源性比對結果顯示,SpCactus與凡納濱對蝦和中國明對蝦的Cactus蛋白同源性均高達62%,相似度為73%。系統(tǒng)進化樹分析顯示,SpCactus與甲殼動物聚為一支,與無脊椎動物聚為一大支。實時熒光定量PCR(RT-PCR)檢測發(fā)現(xiàn),SpCactus基因在擬穴青蟹不同組織中均有表達,肌肉中的表達量最高,其次為心臟、眼柄、血液和鰓,肝胰腺中的表達量最低。LPS和金黃色葡萄球菌刺激均能顯著誘導SpCactus基因的表達。本實驗成功擴增了SpCactus基因全長,并進行了生物信息學分析、理化性質預測,初步探討了其生物學功能,為進一步研究其在免疫反應中的生物學功能提供參考依據(jù)。
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