芥菜TCP轉錄因子家族全基因組鑒定及表達分析
關鍵詞：芥菜 tcp家族 全基因組鑒定 進化分析 表達分析
摘要：【目的】對芥菜基因組中TCP轉錄因子家族基因成員進行鑒定和序列分析,并分析TCP家族基因在莖發育時期的表達水平,為研究芥菜TCP基因功能和莖膨大機理提供基因源和理論依據。【方法】從蕓薹屬基因組數據庫下載芥菜基因組數據,結合轉錄組數據,對芥菜TCP轉錄因子家族成員進行鑒定,并利用生物信息學方法對該家族成員進行理化性質、亞細胞定位、系統發育關系、基因結構、染色體定位及莖不同發育時期基因表達譜等方面的分析。【結果】芥菜TCP家族共有53個成員;系統進化樹分析可分為兩個大的亞組;TCP基因大都位于細胞核上,但理化性質差異很大;大部分基因沒有內含子,基因結構保守性較高;在染色體上分布不均;表達模式分析顯示TCP家族基因可能在芥菜莖膨大中起重要作用。【結論】鑒定了53個芥菜TCP家族基因成員,并發現PCF亞組成員在芥菜莖發育時期特異性表達,可能在芥菜莖的生長發育過程中起重要作用,該研究為芥菜及其他植物中TCP家族的鑒定和功能研究提供了理論基礎。
四川農業大學學報雜志要求:
{1}來稿請詳細注明作者單位、地址、科室、郵編、辦公電話、手機號碼及E-mail。
{2}內容要新，找準切入點。題材符合本刊覆蓋范圍，突出新理念、新視角、新架構、新觀點，具有原創性。
{3}文稿須附中文標題，不宜超過20字。若論文課題為基金資助項目，請在標題下方注明基金名稱及編號。
{4}參考文獻在文內采用[1] [2] [3]……上標格式順序標識，按文中出現的先后順序編號，并在文后統一著錄文獻詳細信息。
{5}摘要和關鍵詞所有論文均要求有中文摘要和關鍵詞，摘要用第三人稱撰寫，分目的、方法、結果及結論四部分，完整準確概括文章的實質性內容，以150字左右為宜，關鍵詞一般3～6個。
注：因版權方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
