龍眼HD-Zip基因家族生物信息及表達分析
關鍵詞：龍眼 基因 體胚 表達模式
摘要：為了解龍眼HD-Zip基因家族的功能,本研究基于龍眼基因組與轉錄組數據庫,對提取的19個龍眼HD-Zip家族成員的啟動子、可變剪接以及受到調控的miRNA種類進行分析;并采用實時熒光定量PCR技術,分析了在ABA處理下龍眼胚性愈傷組織(embryonic callus,EC)中HD-Zip部分成員的表達模式,以及HD-Zip部分成員在不同體胚階段的表達模式。結果表明:龍眼HD-Zip家族除含有TATA-box和CAAT-box以外還含有大量的光響應元件、激素響應元件以及脅迫響應元件,暗示龍眼HD-Zip家族成員可能參與光反應、激素響應以及非生物脅迫的過程;龍眼HD-Zip在不同組織部位與不同體胚階段的可變剪接方式主要以內含子保留為主;龍眼HD-Zip基因家族成員主要受到miRNA166a的調控;在外源激素ABA處理下龍眼EC中HD-Zip家族部分成員的表達模式以及部分成員在不同體胚階段的表達模式都呈現多樣化,推測龍眼HD-Zip參與龍眼不同體胚發育的調控,并且可能通過調節內源ABA的濃度進而影響胚性愈傷組織的生長發育以及形態的建成。
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