秋水仙堿誘導杉木胚珠基因的表達變化
關鍵詞：秋水仙堿 杉木 胚珠 轉(zhuǎn)錄組 基因表達
摘要：杉木(Cunninghamia lanceolata)具有胚珠裸露的特點,為秋水仙堿快速進入胚珠內(nèi)部從而提高誘導效率提供了有利條件。為研究秋水仙堿對胚珠的誘導效果,本研究采用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)分析杉木胚珠在秋水仙堿處理后的基因表達變化,并利用qRT-PCR技術(shù)對相關基因進行表達驗證。結(jié)果顯示,對于秋水仙堿處理組和對照組,轉(zhuǎn)錄組測序分別獲得6.39和6.96 Gb原始數(shù)據(jù),從頭組裝共獲得60 790條unigenes;兩組間共篩選出1 430個差異表達基因,從中獲得紡錘體形成相關基因4個,DNA復制相關基因8個,調(diào)控細胞周期相關基因6個,都呈現(xiàn)顯著下調(diào)表達。qRT-PCR分析表明,NEDD1 (neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated gene 1)、MCM3 (minichromosome maintenance complex component 3)、MCM7、CDC6 (cell division cycle 6)和ATXR6 (trithorax-related protein 6)基因在秋水仙堿處理前后的表達趨勢與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果一致。本研究將秋水仙堿直接作用于胚珠并篩選得到差異表達基因,為深入研究秋水仙堿誘導多倍體的分子機理提供了基礎資料。
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