球孢白僵菌Bbpks1基因的序列分析及其最佳表達培養(yǎng)基的篩選
關(guān)鍵詞：球孢白僵菌 聚類分析 基因表達
摘要：采用基因組挖掘的方法從球孢白僵菌基因組中獲得了一條雜合PKS/NRPS基因(命名為Bbpks1),通過生物信息學分析預測了該基因的功能,檢測了該基因在不同碳源、氮源培養(yǎng)基上的表達情況.結(jié)果顯示:Bbpks1基因長度為11838bp,編碼3945個氨基酸,其結(jié)構(gòu)域順序為KS-AT-DH-MT-KR-ACP-C-A-PP-SDR;BbPKS1蛋白與布氏蟲草、半翅輪枝菌、塔賓曲霉等真菌中的雜合PKS/NRPS蛋白序列(GenBank登錄號分別為OAA40809.1、CEJ94083.1、OJI88893.1)聚為一個分支,且與參與細胞松弛素和伊快霉素合成的蛋白的親緣關(guān)系較近,可推測該基因在球孢白僵菌中參與2,4-吡咯酮型化合物的合成;Bbpks1基因在含有乳糖、肌醇碳源的培養(yǎng)基上表達量較高,在以麥芽糖作為碳源的培養(yǎng)基上不表達,在含不同氮源的培養(yǎng)基上均大量表達.
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